本文系生物谷原創編譯，歡迎分享，轉載須授權！論文標題SARS-COV-2于2019年12月下旬就已在法國傳播（SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019）論文作者來自法國塞納-圣但尼醫院集團、法國國家健康與醫學研究院和巴黎大學發文時間：2020年5月3日在線發表在國際期刊International Journal of Antimicrobial Agents上。引 言法國于2020年1月24日報告了首批SARS-COV-2相關感染病例，2例病例均有前往中國武漢市的旅行史。據我們所知，這2例病例被認為是法國的首批確診病例。COVID-19最常伴有流感樣疾病（influenza-like illness, ILI）。當中國面臨COVID-19爆發時，歐洲國家正與季節性流感作斗爭。鑒于COVID-19和流感樣疾病之間的臨床癥狀相似，因此我們決定回顧性地在巴黎附近的我院（指的是塞納-圣但尼醫院，下同）重癥監護室（ICU）收集的呼吸道樣本中尋找SARS-COV-2。方法-回顧性分析選定的記錄我們回顧性分析2019年12月2日~2020年1月16日期間因ILI而住院的ICU患者的病歷，入院時多重FilmArray PCR（可檢測20種導致上呼吸道感染的常見病毒和細菌，包括流感病毒、常見冠狀病毒，但不包括SARS-COV-2）測試結果為陰性。我院采集的每份呼吸道樣本均在ThermoScientific公司的-86°C冷凍室中冷凍，保存4年，以備進一步分析。根據病歷，對同時有ILI癥狀（發熱高于38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛）和磨玻璃樣陰影（ground glass opacity）的患者采集的樣本進行SARS-COV-2 RT-PCR。樣本選擇說明見圖1。圖1.用于測試的樣本選擇過程。COVID-19測試在2020年4月6日~9日期間對14個選定的生物庫進行了SARS-COV-2 RT-PCR測試。嚴格按照Charité方案在QuantStudio7（Thermofisher）設備上進行針對SARS-COV和 SARS-COV-2泛基因組中編碼包膜蛋白的E基因的RT-PCR測試。根據制造商的建議，用Gene finder COVID19 Plus RealAmp試劑盒（IFMR-45）對陽性結果進行驗證（圖2）。這種試劑盒針對3個病毒基因（RdRp、E和N基因，分別編碼病毒RNA依賴性RNA聚合酶、包膜蛋白和核衣殼蛋白）和細胞RNAse P基因進行檢測，以確認呼吸道樣品的質量。
圖2.依照Charité方案的RT-PCR測試結果。研究結果在研究期間，我們的分析中納入了58例因ILI而住院的患者中的14例（24%）。其中1例樣本為陽性，獲取自一名42歲的在阿爾及利亞出生的男性，他在法國生活多年，是一名魚販子。他的最后一次旅行是在2019年8月期間前往阿爾及利亞。在他的癥狀出現之前，他的一個孩子已出現了ILI。他的病史包括哮喘和II型糖尿病。他出現咯血、咳嗽、頭痛、發燒等癥狀，持續4天，并于2019年12月27日前往急診病房。初步檢查無異常，所做CT掃描顯示雙側下葉磨玻璃樣陰影（圖3），入院時他有淋巴細胞減少癥，C反應蛋白和纖維蛋白原升高，但原降鈣素處于正常范圍。在急診病房采集的痰液樣本中沒有發現病原體。這名患者入住ICU，接受抗生素治療，因病情發生好轉于2019年12月29日出院。
圖3.在基線時進行胸部CT掃描。討 論我們報告了一例COVID-19患者，該患者比法國的首批報道病例早了一個月。入院時，這名患者出現了之前在中國和意大利患者隊列中常見的臨床癥狀和放射學模式。確定第一例感染患者具有重大的流行病學意義，這是因為它極大地改變了我們對SARS-COV-2及其在法國傳播的認識。此外，由于這名患者與中國沒有聯系，最近也沒有旅行，這表明這種疾病在2019年12月底就已經在法國人群中傳播。還需要開展進一步的研究來評估SARS-COV-2在法國境內的實際發生情況、2019年末和2020年1月期間SARS-COV-2在人群中的實際傳播程度，并探索當時可能發生的未被注意到的死亡情況。截至2020年5月10日，法國境內存在176782例COVID-19病例，其中26313例死亡，但是我們的研究結果表明，這些數字可能低估了COVID-19的實際負擔。最近的2項研究提示著大約18%~23%的SARS-COV-2感染者是無癥狀的；大約55%的感染者是由身份不明的感染者引起的。我們的結果強烈支持這兩種觀點，提出在2020年1月期間，許多無癥狀的患者沒有被診斷出來，并促成了這一流行病的傳播。此外，由于這些結果改變了我們對COVID-19疫情動態的理解，這也意味著用于預測SARS-COV-2傳播的演變和結果的幾個模型可能是基于有偏差的數據，需要根據疫情的實際概況進行調整。我們的研究存在幾個局限性。首先，由于所進行的分析是回顧性的，病歷資料并不全面，可能遺漏了一些相關信息。其次，由于RT-PCR的靈敏度和可能損害樣本質量的儲存技術，我們無法排除假陰性結果。為了避免任何假陽性結果，我們采取了所有通常的預防措施，我們通過兩種不同的技術和不同的工作人員對測試結果進行驗證。第三，我們將我們的分析限制在少數樣本上，我們將所選的醫學記錄限制在僅限于癥狀和胸部CT相符的ICU患者，即使大多數患者實際上有輕微的癥狀。第四，我們將分析范圍限制在當時多重FilmArray PCR測定結果為陰性的患者中，盡管文獻中已經描述了交叉感染的情況。最后，我們在巴黎北部地區進行了一項單中心研究，該地區在這一流行病中面臨著特別高的負擔。這些限制可能解釋著為何我們只能在我們研究的人群中識別出一例SARS-COV-2感染者。參考資料：A Deslandes et al.SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019. International Journal of Antimicrobial Agents, 2020, doi:10.1016/j.ijantimicag.2020.106006.歡迎個人轉發到朋友圈
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