本文系生物谷原創(chuàng)編譯，歡迎分享，轉(zhuǎn)載須授權(quán)！論文標(biāo)題SARS-COV-2于2019年12月下旬就已在法國傳播（SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019）論文作者來自法國塞納-圣但尼醫(yī)院集團(tuán)、法國國家健康與醫(yī)學(xué)研究院和巴黎大學(xué)發(fā)文時(shí)間：2020年5月3日在線發(fā)表在國際期刊International Journal of Antimicrobial Agents上。引 言法國于2020年1月24日報(bào)告了首批SARS-COV-2相關(guān)感染病例，2例病例均有前往中國武漢市的旅行史。據(jù)我們所知，這2例病例被認(rèn)為是法國的首批確診病例。COVID-19最常伴有流感樣疾病（influenza-like illness, ILI）。當(dāng)中國面臨COVID-19爆發(fā)時(shí)，歐洲國家正與季節(jié)性流感作斗爭。鑒于COVID-19和流感樣疾病之間的臨床癥狀相似，因此我們決定回顧性地在巴黎附近的我院（指的是塞納-圣但尼醫(yī)院，下同）重癥監(jiān)護(hù)室（ICU）收集的呼吸道樣本中尋找SARS-COV-2。方法-回顧性分析選定的記錄我們回顧性分析2019年12月2日~2020年1月16日期間因ILI而住院的ICU患者的病歷，入院時(shí)多重FilmArray PCR（可檢測20種導(dǎo)致上呼吸道感染的常見病毒和細(xì)菌，包括流感病毒、常見冠狀病毒，但不包括SARS-COV-2）測試結(jié)果為陰性。我院采集的每份呼吸道樣本均在ThermoScientific公司的-86°C冷凍室中冷凍，保存4年，以備進(jìn)一步分析。根據(jù)病歷，對同時(shí)有ILI癥狀（發(fā)熱高于38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛）和磨玻璃樣陰影（ground glass opacity）的患者采集的樣本進(jìn)行SARS-COV-2 RT-PCR。樣本選擇說明見圖1。圖1.用于測試的樣本選擇過程。COVID-19測試在2020年4月6日~9日期間對14個(gè)選定的生物庫進(jìn)行了SARS-COV-2 RT-PCR測試。嚴(yán)格按照Charité方案在QuantStudio7（Thermofisher）設(shè)備上進(jìn)行針對SARS-COV和 SARS-COV-2泛基因組中編碼包膜蛋白的E基因的RT-PCR測試。根據(jù)制造商的建議，用Gene finder COVID19 Plus RealAmp試劑盒（IFMR-45）對陽性結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證（圖2）。這種試劑盒針對3個(gè)病毒基因（RdRp、E和N基因，分別編碼病毒RNA依賴性RNA聚合酶、包膜蛋白和核衣殼蛋白）和細(xì)胞RNAse P基因進(jìn)行檢測，以確認(rèn)呼吸道樣品的質(zhì)量。
圖2.依照Charité方案的RT-PCR測試結(jié)果。研究結(jié)果在研究期間，我們的分析中納入了58例因ILI而住院的患者中的14例（24%）。其中1例樣本為陽性，獲取自一名42歲的在阿爾及利亞出生的男性，他在法國生活多年，是一名魚販子。他的最后一次旅行是在2019年8月期間前往阿爾及利亞。在他的癥狀出現(xiàn)之前，他的一個(gè)孩子已出現(xiàn)了ILI。他的病史包括哮喘和II型糖尿病。他出現(xiàn)咯血、咳嗽、頭痛、發(fā)燒等癥狀，持續(xù)4天，并于2019年12月27日前往急診病房。初步檢查無異常，所做CT掃描顯示雙側(cè)下葉磨玻璃樣陰影（圖3），入院時(shí)他有淋巴細(xì)胞減少癥，C反應(yīng)蛋白和纖維蛋白原升高，但原降鈣素處于正常范圍。在急診病房采集的痰液樣本中沒有發(fā)現(xiàn)病原體。這名患者入住ICU，接受抗生素治療，因病情發(fā)生好轉(zhuǎn)于2019年12月29日出院。
圖3.在基線時(shí)進(jìn)行胸部CT掃描。討 論我們報(bào)告了一例COVID-19患者，該患者比法國的首批報(bào)道病例早了一個(gè)月。入院時(shí)，這名患者出現(xiàn)了之前在中國和意大利患者隊(duì)列中常見的臨床癥狀和放射學(xué)模式。確定第一例感染患者具有重大的流行病學(xué)意義，這是因?yàn)樗鼧O大地改變了我們對SARS-COV-2及其在法國傳播的認(rèn)識。此外，由于這名患者與中國沒有聯(lián)系，最近也沒有旅行，這表明這種疾病在2019年12月底就已經(jīng)在法國人群中傳播。還需要開展進(jìn)一步的研究來評估SARS-COV-2在法國境內(nèi)的實(shí)際發(fā)生情況、2019年末和2020年1月期間SARS-COV-2在人群中的實(shí)際傳播程度，并探索當(dāng)時(shí)可能發(fā)生的未被注意到的死亡情況。截至2020年5月10日，法國境內(nèi)存在176782例COVID-19病例，其中26313例死亡，但是我們的研究結(jié)果表明，這些數(shù)字可能低估了COVID-19的實(shí)際負(fù)擔(dān)。最近的2項(xiàng)研究提示著大約18%~23%的SARS-COV-2感染者是無癥狀的；大約55%的感染者是由身份不明的感染者引起的。我們的結(jié)果強(qiáng)烈支持這兩種觀點(diǎn)，提出在2020年1月期間，許多無癥狀的患者沒有被診斷出來，并促成了這一流行病的傳播。此外，由于這些結(jié)果改變了我們對COVID-19疫情動態(tài)的理解，這也意味著用于預(yù)測SARS-COV-2傳播的演變和結(jié)果的幾個(gè)模型可能是基于有偏差的數(shù)據(jù)，需要根據(jù)疫情的實(shí)際概況進(jìn)行調(diào)整。我們的研究存在幾個(gè)局限性。首先，由于所進(jìn)行的分析是回顧性的，病歷資料并不全面，可能遺漏了一些相關(guān)信息。其次，由于RT-PCR的靈敏度和可能損害樣本質(zhì)量的儲存技術(shù)，我們無法排除假陰性結(jié)果。為了避免任何假陽性結(jié)果，我們采取了所有通常的預(yù)防措施，我們通過兩種不同的技術(shù)和不同的工作人員對測試結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。第三，我們將我們的分析限制在少數(shù)樣本上，我們將所選的醫(yī)學(xué)記錄限制在僅限于癥狀和胸部CT相符的ICU患者，即使大多數(shù)患者實(shí)際上有輕微的癥狀。第四，我們將分析范圍限制在當(dāng)時(shí)多重FilmArray PCR測定結(jié)果為陰性的患者中，盡管文獻(xiàn)中已經(jīng)描述了交叉感染的情況。最后，我們在巴黎北部地區(qū)進(jìn)行了一項(xiàng)單中心研究，該地區(qū)在這一流行病中面臨著特別高的負(fù)擔(dān)。這些限制可能解釋著為何我們只能在我們研究的人群中識別出一例SARS-COV-2感染者。參考資料：A Deslandes et al.SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019. International Journal of Antimicrobial Agents, 2020, doi:10.1016/j.ijantimicag.2020.106006.歡迎個(gè)人轉(zhuǎn)發(fā)到朋友圈
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